여신 기숙사의 사감군

집이 불타고, 아버지는 실종됐고, 모아놓은 돈도 없다. 남자 중학생 나구모 코시는 도시를 떠돌다 길에서 쓰러진다. 우연히 만난 여대생 와치 미네루의 제안으로 그녀가 살고 있는 대학생 기숙사 `여신 기숙사`의 사감이 되었다. 여자 기숙사에서 코시가 만난 사람들은 남자에 대한 내성이 제로인 `초순정녀 사오토메 아테나` 부끄러울 땐 주먹이 나가는 `무투파 소녀 센쇼 키리야` 남에게 코스프레 착장을 입히는 것을 제일 좋아하는 `폭주 코스플레이어 프레이` 나태한 체육복 차림의 `전파녀 호즈미 세레네` 수상한 실험을 반복하는 `매드 사이언티스트 와치 미네루`였다. 모두가 하나둘씩 이상한 특징이 있는 문제 있는 미소녀들. 사감으로서 그녀들과 함께 지내며 알아가는 동안에 강해지는 유대. 연상 누나들에게 휘둘리는 코시의 일상이 시작된다!!